Изменения климата могут значительно сократить или привести к исчезновению некоторых реликтовых растительных сообществ заповедника.
Видовое богатство высокогорной флоры Лагонакского отдела заповедника превышает флоры Урала и Саянов.
Присутствие арктических растений во флоре заповедника связано с их миграцией во время последнего ледникового периода.
На территории заповедника не представлено всё многообразие лесных сообществ Западного Кавказа.
Представители колхидского подлеска пережили ледниковый период в горах под снеговым покровом.